Лицей №3 входит в число 20 пилотных школ региона, в которых в рамках эксперимента идёт опережающее ведение федеральных государственных образовательных стандартов (ФГОС) нового поколения. Стандарт вводится поэтапно: сначала начальная школа, затем — основная, и позже — средняя. В 2010-2011 учебном году новые стандарты начального общего образования были введены в 1 классе. А в следующем году все первые классы во всех школах России начали учиться по новым ФГОС начального общего образования.В 2012-2013 учебном году в лицее №3 вводятся ФГОС нового поколения в 5-х классах. Введение нового Стандарта требует изменения основной образовательной программы основного общего образования (на второй ступени образования с 5 по 9 класс). Педагогический совет, прошедший недавно в лицее, провел экспертизу основной образовательной программы в соответствии с ФГОС нового поколения, проанализировал подготовительную работу и принял с внесёнными изменениями основную образовательную программу основного общего образования лицея №3 города Галича на 2012-2017 годы.
